一、农业防治
清园：种植花生之前和花生收获之后，都要及时的对田间残留的植株进行清理，可以集中烧毁或者是拿去沤制肥料，清园能够减少病菌的残留，后期栽种花生的时候就能够减少病害的发生。
轮作：轮作的主要目的就是破坏原病菌的生长环境，防治病菌在土壤中残留过冬。轮作可以和高粱、玉米等作物，如果的连作的话，会加重病害发生的几率，不光是根腐病，还有可能发生其他的病害。
排水：田间需要做好排水的工作，避免土壤长时间湿度过大，尤其是在夏季雨天的时候，如果田间没有排水渠的话，就会导致田间沉积大量的雨水，花生的根系长时间浸泡在积水中就容易出现根腐病的情况。另外在正午高温的时候也不能浇水，土壤温度太高，容易烫伤花生的根系。
选种：在种植花生的时候，需要选择抗病性强的品种，比较常见的优良品种有：桂花17号、桂花22号、鲁花6号、鲁花9号等等，如果种子抗病害能力较差的话，就容易被各种病害侵袭。
二、化学防治
包衣：种子在种植之前，可以用药物对种子进行包衣，能够提高种子在苗期、生长期和果期的抗病性，比如用0.04-0.08%的35%精甲霜灵种子处理乳剂、0.6-0.8%的2.5%咯菌腈悬浮种衣剂、3%苯醚甲环唑悬浮种衣剂1:（250-500）等等，都有非常不错的效果。
药剂：如果已经出现根腐病的话，可以用70%敌磺钠可溶粉剂300-500克、30%醚菌酯悬浮剂50-70毫升、50%腐霉利可湿性粉剂600-800倍液等，用配制好的药液喷淋花生根茎基部的位置，每次施药的时候需要交替使用，坚持用药2-3次就可以看到效果了。