山茱萸和蛀果蛾（萸肉食心虫、萸肉虫）
蛀果蛾主要蛀食果肉，虫害率较高。在果实成熟期，为害更为严重。
一般蛀果蛾出现的时候，可以喷2.5%的溴氰菊酯5000~8000倍液或20%杀灭菊酯2000~4000倍液进行防治。或者是进行土壤消毒处理，也可以利用食醋加敌百虫制成毒饵，诱杀成蛾。
其次便是要在采收果实后及时加工，不宜存放过久，以减少害虫的蔓延。
山茱萸和大蓑蛾（避债蛾）
大蓑蛾的幼虫咬食叶片，严重时，可将山茱萸树叶全部吃光。使其长势减弱，果实减少。
一般，山茱萸出现大蓑蛾的时候可以人工捕杀，在冬季落叶后，结合整枝，摘取挂在树枝上的袋囊。也可以安装黑光灯，诱杀成蛾。喷药防治主要是在虫害发生期，喷射10%杀灭菊酯2000~3000倍液或40%氧化乐果1000倍液。也可以进行生物防治。
山茱萸和木撩尺蠖（造桥虫）
木撩尺蠖的幼虫咬食叶片，造成枝条光秃，使树势生长减弱，结果少。
7月份是幼虫盛期，要及时喷90%的敌百虫1000倍液进行防治。早春时，可以挖土灭蛹或土壤消毒，防止蛹羽化。
山茱萸和叶蝉
叶蝉的成虫刺吸嫩枝和叶片，严重的使枝条干枯、落叶，影响树木生长。
防治方法是用50%的磷胺乳剂2000倍液或菊酯类药5000-8000倍液喷雾。
山茱萸和刺蛾
刺蛾的幼虫啮食叶肉，影响树势，造成落花落果，降低产量。
山茱萸出现刺耳可以灯光诱杀，或是消灭越冬茧。还可以化学防治，喷洒溴氰菊酯5000-8000倍液喷洒80%的敌敌畏1000倍液。
山茱萸和介壳虫
介壳虫以草履蚧、牡蛎蚧为多，若虫吸食汁液，影响树木生长。
一般山茱萸发生介壳虫危害时可以引进天敌或者人工防治，或40%的氧化乐果乳油1000倍液，每隔7~10天喷1次，共喷3次。