1、种属类别
这可以说是它们二者最根本的区别了，种属正是我们区分不同植物的根本标准。对于第一种植物来说，它是属于玄参科、胡黄连属的；而对于第二种植物来说，它是属于毛莨科、黄连属的。第一种植物的别称有“胡连”、“割孤露泽”；第二种植物的别称有“味连”、“川连”等。种属的不同决定了它们在许多方面都有差别。
2、分布地区
首先说说它们分布海拔的不同。前者主要分布的海拔范围在三千六百到四千四百米，长于高寒地区的岩石或者石堆之中；后者的分布海拔相比较而言要低得多，主要在一千五百到二千三百米这个范围内，大都在密林之中。再就是它们分布地的差别，第一类植物在印度、还有印度尼西亚的分布特别多；而第二类植物在我国的分布非常广，主要在四川、贵州、湖北、湖南等省份。
3、药用价值
这里说的并不是它们的价值有的大，有的小，而是它们主要的功效方面有差别。比如，第一种植物主要是用来退虚热的，第二种植物则是用来泻胃火、清心火的，并且可以用来解毒。
4、外观方面
它们之间主要是叶片的区别。前者的叶子是匙形状的；而后者的是卵状三角形的。
5、花果期
第一类的花期在六月份，果期在七月份；第二类则在二到三月开花，四到六月结果。