一、株型区别
唐菖蒲的球茎呈扁球形，直径在2.5-4.5cm之间。它的外面包被着一层棕色或者黄棕色的膜。而菖蒲的根茎横向生长，略扁，直径为0.5cm-1cm。它的外面包被着一层黄褐色的皮。
二、叶片区别
唐菖蒲的叶片呈剑形，长度为40-60cm，宽度为2-4cm。而菖蒲的叶片成剑状线形，基处较宽，逐渐变窄。它叶片的长度在90-150cm之间，中间部分叶片的宽度为1-3cm。
三、花的区别
唐菖蒲的花序为蝎尾状单歧聚伞花序，没有花梗，花朵有红、黄、白等多种颜色。菖蒲的花序为狭锥状圆柱形，花朵多为黄绿色。