一、叶子区别
树番茄叶子互生，呈卵形或卵状心形，长大约5到15厘米，宽大约5到10厘米，叶子顶端逐渐变尖，基部偏斜，有深弯缺，叶子全缘或略微波浪状。叶面深绿色，背面淡绿色，叶柄长3到7厘米。
番茄叶子羽状复叶或羽状深裂，长10到40厘米，小叶不规则，通常5到9枚，呈卵形或矩圆形，长5到7厘米，边缘具有不规则锯齿或裂片。
二、花朵区别
树番茄聚伞式花序近腋生或腋外生长，花梗长1到2厘米 花萼呈辐状，直径大约6毫米，长有短绒毛。花冠呈辐状，粉红色，直径在1.5到2厘米，具有5深裂，裂片呈披针形。
番茄花朵黄色，花冠辐状，直径在2厘米左右，花萼裂片呈披针形。
三、果实区别
树番茄果实呈卵状，汁液多，长大约5到7厘米，表面光滑，颜色呈桔黄色或带红色。
番茄浆果扁球形或近球形，肉质，多汁液，颜色呈桔黄色或鲜红色，表面光滑。