一、处理方法
首先要将它从盆土中取出来，将泥土清除干净，并用水清洗一下，再用剪刀将腐烂的根系剪掉，直到露出健康的根部，再将根部进行消毒，准备好新的土壤以及花盆，等它晾干之后，重新将它栽种就可以了。
二、预防方法
1、科学浇水
原因：不要过量给矮牵牛浇水，一旦土壤过于湿润或有积水出现，会不利于根部的生长，还很容易导致烂根的情况发生，它的根部再生能力很差，烂根后一般很难挽救。
解决方法：浇水量一定要控制好，一次性浇透即可，要等土壤变干后再浇水，浇水不能太多尤其是在夏天，更要减少浇水，另外土壤的排水性也要好，这样才能将多余的积水排出，它也会更健康的生长。
2、适当遮雨
原因：矮牵牛最怕的就是雨季，雨季过多时如果依然在室外养殖，或者不遮雨，它一定会烂根的，严重还会导致植株死亡。
解决方法：雨季要及时为它遮雨，将它放在室内或者不被雨淋的地方，如果遮雨不及时，那就及时采取适当的排水措施，不要让盆土中的积水长期残留。