凤眼蓝导致生态破坏
凤眼蓝的危害之一就是会导致生态的破坏，因为它的繁殖能力很强，如果生存的环境适合凤眼蓝的生长，那么它将会大量的繁殖，并且成为优势的物种，影响其他生物的生长，长久下去，该地区的生态多样性便会被破坏，而使其物种单一。
一个地区的生态平衡非常重要，各物种相互影响，相互抑制，才能保持平衡。而凤眼蓝的疯狂生长，在很大的程度上会打破该地区的平衡，剥夺其他生物的生存空间，使得某些物种濒临灭绝。
凤眼蓝影响其他生物的生长
当凤眼蓝在生长的很旺盛的时候，会长满整个水域，覆盖整个水面，将水面染成绿色。此时，会影响水中和大气的气体的交换，以及光线的传递，并会增CO2的浓度，影响水生生物。
凤眼蓝会堵塞河道
疯狂生长的凤眼蓝是会堵塞水道的。
因为凤眼蓝的植株大量的繁殖，植株不断的变多，很快就会覆盖整个河道，在严重的时候，凤眼蓝生长的密集程度甚至可以让人在上面行走，影响水运。此外，凤眼蓝的生长甚至会影响水厂自来水的生长，因为过度繁殖的凤眼蓝会堵塞自来水的生产设备。
凤眼蓝危害的治理
一旦凤眼蓝危害发生，采用除草剂等来进行防治效果并不大，既有污染，费用也比较高。
一般在治理凤眼蓝危害的时候，采取无污染的方式，可以引进凤眼蓝的天敌，例如儒艮等，效果较好。