一、通风不好
盆栽的百合在生长的过程中需要好的通风，要是处在的生长环境过于闷热，会导致长势出现问题，从而使百合杆发黑。一般是放在通风好的窗台，尤其是在夏季更需注意通风，在天气好的时候可以放在室外养护。
二、施水太勤
它是球茎类的植物，能耐得住干旱，如果发现盆土变干就浇水，会导致施水太勤，导致盆土中出现积水，可能会导致根部出现窒息烂掉，从而影响到输送的功能，出现茎杆发黑，花苞掉落出现黄叶等问题。平常需根据长势给水，等到土层干透后再给水，也要注意好水量，防止施水过多。
三、温度偏低
百合适合在16-24摄氏度的温度范围内生长，要是冬季的温度低于5摄氏度，生长就会停滞，从而受到冻伤，茎杆部分就会发黑，枝叶、花朵都会出现问题。它的耐寒性稍差一些，所以冬季要注意保暖，温度维持在10摄氏度以上最佳。
四、施肥不当
它需要一定的肥料补充生长，但如果肥料浓度过高，会导致根部烧坏，从而导致茎杆发黑。